第一，培养目标不同。专业硕士与学术硕士处于同一层次，培养规格各有侧重，在培养目标上有明显差异。

专业硕士教育的突出特点是学术型与职业性紧密结合，获得专业学位的人，主要不是从事学术研究，而是从事具有明显职业背景的工作，如工程师、医师、教师、律师、会计师等。这是一种以专业实践为导向，重视实践和应用，培养在专业和专门技术上受到正规的、高水平训练的高层次人才的培养方式。学术硕士按学科设立，其以学术研究为导向，偏重理论和研究，培养大学教师和科研机构的研究人员。

第二，培养方式不同。

专业硕士课程设置以实际应用为导向，以职业需求为目标，以综合素养和应用知识与能力的提高为核心。教学内容强调理论性与应用性课程的有机结合，突出案例分析和实践研究;教学过程重视运用团队学习、案例分析、现场研究、模拟训练等方法;注重培养学生研究实践问题的意识和能力。在具体的学习过程中，要求有为期至少半年的实践环节，实践学分比重较学术学位更大。

学术硕士的课程设置侧重于加强基础理论的学习，重点培养学生从事科学研究创新工作的能力和素质。

第三，调剂要求不同。

考生调剂基本条件，初试科目与调入专业初试科目相同或相近，其中统考科目原则上应相同。学硕的考试科目一般可以涵盖专硕的初试科目或者达到专硕的考试难度，因此调剂一般为学硕向专硕调剂。专硕的考试科目和考试难度决定了它几乎没有调剂到学硕的可能性。即，学术硕士可以调剂到专业硕士，但专业硕士不能调剂到学术硕士。

第四，学费标准不同。

全日制专业硕士收费标准，按不高于本校现行普通专业学术型自筹经费研究生收费标准确定(没有普通专业学术型自筹经费研究生的学校，应参照当地其他院校同类专业的有关收费标准确定)。从2014年秋季学期起，学术硕士收费标准，原则上每年硕士生不超过8000元、博士生不超过10000元。一般专业硕士要高于学术硕士的学费。

第五，学制不同。

具体表现为，专业硕士学制一般为2-3年，学术硕士学制一般为3年（部分专业的学硕和专硕学制相同）。具体情况依各招生单位当年政策为准。

第六，导师制度不同。

专业硕士，实行双导师制。根据教育部相关文件精神，各专业学位研究生培养单位要建立健全校内外双导师制，以校内导师指导为主，校外导师应参与实践过程、项目研究、课程与论文等多个环节的指导工作。在培养过程中校内导师以教授理论知识、学术指导为主，而校外导师则以培养技能、指导实践为主。

学术硕士，实行单导师制。在基本职能方面，研究生导师对学生进行研究生课程教学、课题研究指导与学位论文指导。在导学内容方面，研究生导师对其研究生在读研期间的全过程进行指导。研究生论文完成后，指导教师要对研究生作出客观、全面、准确的评价，并负责向导师组申请审查同意，提交院学位评定委员会，申请组织答辩。

第七，学位论文不同。

专业硕士的论文，必须强化应用导向，形式可多种多样。鼓励采用调研报告、规划设计、产品开发、案例分析、项目管理、文学艺术作品等多种形式。

学术硕士的学位论文，强调科学理论研究与原创学术创新，形式相对传统，一般为学术性论文。

第八，读博方式不同。

专业硕士，一般不能硕博连读或直博，但硕士毕业后可参与全国统一考试进行考博。

学术硕士，可以通过自己的导师直接读博，不用参加全国统考，也就是我们所说的直博或者硕博连读。